根据《工会法》等相关规定，工会经费收入主要来源有两部分：

一是根据员工工资总额的2%计提的工会经费，这一部分是由员工所在单位计提、上缴上级工会后，将收到由财政部印制的“工会经费专用收据”，以作为企业免税的部分备查；

二是由会员按照中华全国总工会的规定交纳的会费，这部分由会员在收到单位发放工资后自行上交给所在单位，缴纳会员会费是会员享受工会会员权利的义务。

两者差别在于：工会经费是企业的计提、用于工会组织上且免交企业所得税的部分，是大部分工会组织的主要经费来源；会员会费是员工根据自己工资的千分之五主动交给所在工会、不可免个人所得税的，是会员必须履行的义务。